Comarca de Lisboa
O Tribunal Judicial da Comarca de Lisboa é composto por 5 núcleos de secretaria (Lisboa; Almada; Barreiro/Moita; Montijo e Seixal) e 29 Juízos de Competência Especializada.
Existem secções do Departamento de Investigação e Ação Penal (DIAP), num total de 29, 14 instaladas em edifícios próprios sitos em Lisboa (Campus da Justiça), encontrando-se as demais instaladas nos Palácios de Justiça de Almada, Barreiro, Moita, Montijo e Seixal. De salientar a existência de duas Secções Especializadas Integradas de Violência Doméstica (SEIVD), uma em Lisboa e outra no Seixal.
Tribunais de competência territorial alargada
Encontram-se sediados em Lisboa quatro tribunais de competência territorial alargada: o Tribunal Central de Instrução Criminal, o Tribunal da Propriedade Intelectual, o Tribunal das Execução das Penas de Lisboa e o Tribunal Marítimo de Lisboa.